免疫剖析
分散熒光染料符號的單克隆抗體技能為流式細胞儀在研討細胞膜和細胞內各種功能性抗原、腫瘤基因蛋白等范疇擴展了無限的使用空間。熒光探針能夠經過蛋白質交聯劑共價結合在單克隆抗體上。免疫熒光符號最常用的染料有異硫氰酸熒光素(fluorescein isothiocyanate, FITC)、藻紅蛋白（PE）以及AlexaFluor系列染料等。
核酸檢測
核酸染料DAPI可嵌入到DNA雙螺旋中
核酸染料DAPI可嵌入到DNA雙螺旋中
核酸分散熒光染料對細胞核染色后定量丈量細胞所宣布的熒光強度，就能夠斷定細胞核中DNA、RNA的含量，并能夠對細胞周期和細胞的增殖情況進行剖析。有多種熒光染料能夠對細胞中的DNA或RNA染色，常用的DNA染料包含碘化丙啶(PI)、DAPI、Hoechst 33342等，RNA染料有噻唑橙、吖啶橙等。
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