熒光染料是指某一波長的光波后發射出另一波長大于吸收光的光波的物質，多是含有苯環或雜環并帶有共軛雙鍵的化合物。
常用熒光染料詳細介紹如下：
（一）免疫熒光符號常用的熒光染料
FITC（異硫氰酸熒光素）：綠色530nm
PE（藻紅蛋白）：橙黃色575nm
488nm波長的氬離子激光激起
APC（別藻青蛋白）：赤色660nm
630nm波長的氦氖激光或赤色二極管激光激起
PerCP（多甲藻黃素葉綠素蛋白）：深赤色675nm
PI（碘化丙啶）：橙赤色620nm
（二）細胞自發熒光
自發熒光信號為噪聲信號，在大都情況下會攪擾對特異熒光信號的分辯和丈量。在免疫細胞化學等丈量中，關于結合水平不高的熒光抗體來說，怎么進步信噪比是個要害。
（三）免疫熒光符號
常用的符號染色為直接免疫熒光染色和直接免疫熒光染色。在進行雙參數或多參數剖析時，常常需要進行熒光抗體的組合符號，現在已經有雙色、三色以及四色符號。
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